Qué determina si una imagen es recordada u olvidada?

April 2, 2010

Qué determina si una imagen es recordada u olvidada? Nueva evidencia sugiere que estar presente a una tarea en primer plano puede mejorar la memoria para escenas en el transfondo en puntos importantes de conducta en el tiempo. La memoria humana para escenas visuales varía acorde a un número de factores. Entre estos factores están incluidos la novedad de la escena, su importancia en cuanto a conducta y la atención prestada por el sujeto. Comunmente las personas recuerdan los detalles del contexto en el cual reciben noticias dramaticas o impactantes, por ejemplo recordar donde estaban y que estaban haciendo cuando se enteraron que un querido amigo falleció.  Esto presenta la posibilidad que otro factor pueda afectar la memoria, aún para detalles no importantes. En este artículo se presentan los resultados de un nuevo estudio de la memoria en el cual se usó una técnica llamada “presentación visual rápida en serie” or RSVP. 

Citation: Jones R (2010) Memory Is Enhanced at Behaviorally Relevant Times. PLoS Biol 8(3): e1000338. doi:10.1371/journal.pbio.1000338

Published: March 16, 2010

Copyright: © 2010 Rachel Jones. This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.

Competing interests: The author has declared that no competing interests exist.

* E-mail: rachel.jones.1@googlemail.com

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Los organismos extremófilos

December 21, 2009

Hace un tiempo , digamos que solos unas décadas atrás, existía un concenso bien arraigado en la comunidad científica que la vida solo podía existir en un número limitado de ambientes y en  condiciones muy bien definidas. Para nuestra sorpresa y desconcierto, hemos encontrado vida en prácticamente todos los sitios que hemos explorado y en ambientes que anteriormente se suponían incapacesde de sostener vida , la misma vida florece en sitios asombrosos. En este momento la comunidad científica acepta como hecho irrefutable que casi todos los ambientes considerados anteriormente como  inhabitables han sido colonizados por microorganismos perfectamente capaces de adaptarse y florecer en estos nichos ecológicos, espacios ecológicos que presentan condiciones extremas tales como enormes temperaturas, Ph extremos, ausencia total de agua, enormes presiones, etc. Estos organismos que se han adaptado a estas llamadas condiciones extremas son llamados extremófilos.Nosotros los seres humanos no somos organismos extremófilos porque vivimos en la parte considerada habitualmente capaz de sostener vida, situada entre los extremos de las variables ambientales. Por definición los extremófilos viven en las condiciones extremas de variables ambientales. Acorde a la condición extrema que “enfrentan” pueden ser nombrados en diferentes categorías: acidófilos, alcalófilos, termófilos, barófilos… así de esta manera su categorización delata claramente las condiciones de su hábitat. El descubrimiento de los extremófilos ha cambiado para siempre nuestras nociones de lo que es un ambiente habitable y ha obligado a replantear cuales son las condiciones ambientales mínimas que la vida precisa. Les quiero presentar en este posting el artículo de los PloS “Surviving Salt: How Do Extremophiles Do It?”, para mí es un artículo extremadamente interesante y enriquecedor que nos muestra los mecanismos moleculares que poseen esta clase de organismos para lidiar con las condiciones extremas de los ambientes en que viven y prevalecen. Como siempre proveo la citación de la publicación, recuerden que este papel proviene de los PLoS , o sea puede ser reproducido, usado y publicado en otros medios libremente, siempre y cuando crédito completo sea otorgado al autor. Verdadero espiritu académico que espero prevalezca a la larga en este mundo de “grants y peer review journals” .

Citation: Hoff M (2009) Surviving Salt: How Do Extremophiles Do It? PLoS Biol 7(12): e1000258. doi:10.1371/journal.pbio.1000258

Published: December 15, 2009

Copyright: © 2009 Mary Hoff. This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.

Competing interests: The author has declared that no competing interests exist.

* E-mail: maryhoff@nasw.org

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Don Fawcett (1917-2009): Descubriendo los secretos mas ocultos de la naturaleza.

September 7, 2009

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La biología celular le debe muchos de sus grandes descubrimientos al microscopio electrónico y a hombres que dedicaron su vida al uso de este instrumento científico con el propósito de “arrancarle a la naturaleza sus secretos mas preciados y ocultos” . Don Wayne Fawcett perteneció a esa clase de hombres, fué sin lugar a dudas un pionero en el uso del microscopio electrónico y uno de los grandes estudiosos de la organización de las celulas y tejidos usando este preciado instrumento que nos ha permitido visualizar estructuras nuncas antes vistas. Fawcett ha muerto en su casa en Missoula, Montana, el 7 de mayo del 2009 a la avanzada edad de 92 años. Don Wayne Fawcett nació y se crió en un ambiente rural en el estado de Iowa, donde su familia por generaciones se habia dedicado a la ganaderia. Se educó en Boston, donde combinó el estudio formal con investigaciones propias de él, algo bastante inusual para aquellos tiempos y aún para esta epoca. Normalmente los estudiantes en nuestros tiempos, aún en Graduate School, solo se preocupan con los aspectos formales de su educación. Es altamente inusual encontrar estudiantes dispuestos ir la extramilla , y desarrollar sus propios experimentos e investigaciones al margen de los requerimientos formales para obtener su grado académico. Para eso se necesita la motivación de un verdadero científico, para eso se necesita ser un Fawcett.  Al menos esa es mi apreciación personal. Incluyo en mi blog un artículo en formato PDF acerca de Fawcett, por supuesto en lenguage inglés obtenido en el PLoS de Biología, en la edición de Agosto del 2009. De esta clase de hombres necesitamos en nuestros predios académicos, desgraciadamente constituyen la excepción y no la regla.

Obtenga la publicación original en formato PDF desde mi blog.

Citation: Marincola E (2009) Don Fawcett (1917–2009): Unlocking Nature’s Closely Guarded Secrets. PLoS Biol 7(8): e1000183. doi:10.1371/journal.pbio.1000183
Published: August 25, 2009
Copyright: © 2009 Elizabeth Marincola. This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.

* E-mail: emarincola@societyforscience.org


Análisis quantitativo de mecanismos que rigen la edad , estructura y dinámicas de las celulas de globulos rojos durante la anemia perniciosa.

July 12, 2009

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Los globulos rojos son producidos en la médula osea y dispersos posteriormente en el torrente sanguineo. Su población es mantenida en equilibrio por mecanismos extremadamente complejos de retroalimentación negativos. Enfermedades genéticas, patógenos de la malaria, y cambios ambientales pueden alterar este equilibrio, estas alteraciones pueden ser producidas directamente por el exterminio de los globulos rojos o indirectamente afectando los mecanismos de retroalimentación negativa. En esta publicación probamos hipotesis acerca de la naturaleza de estos mecanismos tratando de ajustar modelos matemáticos a la data experimental. Nuestros resultados nos proveen un mejor entendimiento de los mecanismos que controlan la población de globulos rojos y eventualmente mejorará los modelos de enfermedades que afectan a los globulos rojos. La modelación matemática ha provado ser una herrramienta fundamental en identificar y quantificar los mecanismos que rigen la edad, estructura y dinámica poblacional de los globulos rojos. En este artículo se sintetizan ideas de data experiemental obtenida previamente y modelación matemática con nueva data para probar hipótesis y generar nuevas mecanismos de predicción en torno a estos mecanismos.

Obtenga el artículo completo en formato PDF de los repositorios de PLoS

Si algun graduate student en alguna investigación o trabajo de grado utiliza este artículo y encuentra alguna parte confusa o dificil de entender, puede contactarme a mi correo electronico raf6@njit.edu, sino los puedo atender directamente yo, lo remitiré a otros colegas que que han leido y logrado un entendimiento pleno del artículo, estos colegas están dispuestos a ayudar a estudiantes.

Citation: Savill NJ, Chadwick W, Reece SE (2009) Quantitative Analysis of Mechanisms That Govern Red Blood Cell Age Structure and Dynamics during Anaemia. PLoS Comput Biol 5(6): e1000416. doi:10.1371/journal.pcbi.1000416

Editor: Greg Tucker-Kellogg, Lilly Singapore Centre for Drug Discovery, Singapore
Received: October 8, 2008; Accepted: May 13, 2009; Published: June 26, 2009

Copyright: © 2009 Savill et al. This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.

Funding: This work is supported by the Wellcome Trust (082601/Z/07/Z and 002234/Z/07/Z) and NERC (NE/E000886/1). The funders had no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscript. This work has made use of the resources provided by the Edinburgh Compute and Data Facility (ECDF). (http://www.ecdf.ed.ac.uk/). The ECDF is partially supported by the eDIKT initiative (http://www.edikt.org.uk).

Competing interests: The authors have declared that no competing interests exist.

* E-mail: nick.savill@ed.ac.uk


Modelos y submodelos biológicos

May 24, 2009

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Uno de los problemas más críticos que enfrentamos en el estudio de sistemas biológicos es desarrollar modelos estadisticos sólidos que constituyan descripciones cercanas a las realidades biológicas en estudio. Este problema ha sido particularmente insidioso porque los sistemas biológicos tipicamente contienen un inmenso número de variables que interactuan entre ellas, este escenario impide un acercamiento simple a la hora de abordar y crear modelos bioestadisticos. Recientemente, varios grupos han reportado una estrategia alternativa a la hora de enfrentar y desarrollar complejos modelos de naturaleza biológica. Este reporte muestra estos modelos estadistico alternativos y de alta seguridad sin el conocimiento de todas las interacciones de un sistema. Como alternativa al conocimiento de todas las interacciones para contruir el modelo, solo es usado pares de interacciones que son más faciles de identificar y cuantificar. El modelo que se puede obtener con el uso de pares de interacciones es sólido y confiable, en pequeños subsistemas, pero en la mayoría de los casos estos modelos no proveen una descripción sólida ni segura de un verdadero y complejo sistema biológico. Se pueden preveer y obtener un modelo de un sistema complejo biológico a partir de modelos más limitados obtenidos con el analisis de pares de interacciones. Acorde al estudio existe un punto en el poder predictivo de los modelos obtenidos con el analisis de pares de interacciones: si el tamaño del subsistema está por debajo de ese valor , entonces los resultados del subsistema no tienen poder predictivo para sistemas mas complejos. Como contraste, si el tamaño del subsistema esta por encima del valor, el subsistema modelado sobre la base del analisis de pares de interacciones puede ser extrapolado a sistemas más complejos con relativo éxito. Abajo cito toda la información de una publicación PLoS que aborda el tema brillantemente, la citación de la publicación, información como contacto de los autores es proveido. Un link es también proveido para obtener la publicación en formato PDF desde mi blog, puede contactarme si algun problema se presenta durante la lectura del papel.

Citation: Roudi Y, Nirenberg S, Latham PE (2009) Pairwise Maximum Entropy Models for Studying Large Biological Systems: When They Can Work and When They Can’t. PLoS Comput Biol 5(5):

e1000380. doi:10.1371/journal.pcbi.1000380

Editor: Olaf Sporns, Indiana University, United States of America

Received: November 10, 2008; Accepted: April 1, 2009; Published: May 8, 2009

Copyright: © 2009 Roudi et al. This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.

Funding: YR and PEL were supported by the Gatsby Charitable Foundation (http://www.gatsby.org.uk) and by the US National Institute of Mental Health grant R01 MH62447. SN was supported by the US National Eye Institute grant R01 EY12978. The funders had no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscript.

Competing interests: The authors have declared that no competing interests exist.

Email:  pel@gatsby.ucl.ac.uk

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La dinastía de los reyes Hasburgos en España

May 12, 2009

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La dinastía de los reyes Hasburgos en España mantuvieron un patrón de matrimonio entre familiares que incluyó matrimonios entre primos primeros, tios y sobrinas y demás tipos de uniones entre familiares muy cercanos genéticamente. En la historia siempre se ha especulado si este patrón de conducta no fué el motivo de la decadencia y posterior extinctión de la dinastía cuando Carlos II , enfermo y mentalmente incapacitado , murió en 1700 sin descendencia . Con este evento la dinastía terminó su protaganismo histórico en España. En este estudio se hace un análisis biológico computacional sobre esta idea comunmente sostenida que los matrimonios entre familiares cercanos dentro de la dinastía es responsable de su desaparición. La publicación está escrita en lengua inglesa y es resultado de una extensa investigación realizada en la Universidad de Santiago de Compostela, este papel fue sometido al PLoS lo que me permite publicarlo libremente en mi blog. Recuerden que soy un ferviente seguidor de los principios del PLoS, no olvido mis tiempos en Graduate School en los que tenia que pagar por obtener publicaciones , en ocasiones de muy cuestionable valor científico.

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